制度是成吉思汗防止旧贵族复辟的重要措施。任何千户长，不管地位多么尊崇，都是皇室的臣仆。那颜阶级是成吉思汗“黄金家族”统治人民的支柱。
为确保至高无上的汗权，成吉思汗建立了一支更强大的由大汗直接控制的常备武装。他将护卫军扩充至万名，由1000名宿卫、1000名箭筒士和8000名散班组成。其主要责任是保护大汗的金帐和分管汗廷的各种事务，同时也是大汗亲自统领的作战部队。
成吉思汗规定了严格的护卫轮流值班制度。成吉思汗令其最亲信的博尔忽、博尔术、木华黎、赤老温4家世袭担任四个护卫之长。他们是大汗的亲信内臣。护卫之长作为大汗的侍从近臣，地位居于千户那颜之上，担任着中央政府的职能。他们还常作为使者出外传达旨意，处理重大事务。其调任外官，多担任重要职务。因此，充任卫士成为那颜阶级做官的最便捷的途径。
成吉思汗掌握着这样一支最强悍的亲信军队，足以制约任何一个在外的诸王和那颜。而各级那颜的子弟被征为护卫军，等于“质子”，这有助于成吉思汗更牢固地联系和控制分布在各地的那颜，使他们效忠于自己。护卫军成为成吉思汗巩固新生的统一国家、防止旧贵族复活和对外进行掠夺扩张的有力工具。
成吉思汗建国以前，蒙古人还没有文字。成吉思汗俘获畏兀儿人塔塔统阿后，因他精通本国文字，就命他教子弟学习。其后又有不少畏兀儿人被用为蒙古贵族子弟的教师，他们对蒙古文的创制做出了贡献。
畏兀儿蒙古文创制出来以后，成吉思汗就用它发布命令，登记户口，编集成文法，记录所办案件等，成为加强统治的重要辅助手段。
开禧二年（公元1206年），成吉思汗任命其养子失吉忽秃忽为大断事官。大断事官专门负责掌管民户的分配。成吉思汗又命失吉忽秃忽审断刑狱词讼，负责惩治盗贼，察明诈伪，施以刑法。大断事官实际上是蒙古国的最高行政官，相当于汉族官制中的丞相。大断事官之下还有若干断事官作为僚属。此外诸王、贵戚、功臣有分地者，也各置断事官管治其本部百姓。
在蒙古人长期形成的种种社会习惯和行为规范的基础上，成吉思汗重新确定了训言、札撒和古来的体例，制定了蒙古法律“大札撒”。札撒主要由习惯法和训令构成。它是当时人民必须遵奉的法律。它规定：那颜们除君主外不得投托他人，违者处死；擅离职守者处死；构乱皇室、挑拨是非、助此反彼者处死；收留逃奴而不交还其主者处死；盗人马畜者，除归还原马外，另赔偿同样的马9匹，如不能赔偿，即以其子女作抵，如无子女，则将其本人处死等等。这些无疑都是保护最高统治权和那颜阶级利益的条款。此外，札撒还有一些保护游牧经济和社会秩序的条款。“札撒”的制定，对统治被征服的民众，使人民各安其位，整顿社会秩序，加强蒙古政权等起到了积极作用。
成吉思汗统一蒙古的业绩以及他加强集权统治的措施，构建了蒙古帝国的基本骨架，为他在更大范围内进行扩张战争奠定了基础。
四、对内征讨伐夏灭金
统一蒙古后，征服邻国就成为成吉思汗的主要目标。当时，他的兵力总数已超过10万。在征服诸国的过程中，蒙古国的兵力又不断得到扩充。
党项贵族建立的西夏政权成为蒙古人征服的第一个目标。成吉思汗早已谋划着进攻金国，但他担心西夏与金国合力从两面牵制蒙古。为免除西夏可能构成的侧面威胁，他采取了先攻西夏扫清外围的战略。开禧元年（公元1205年）三月，成吉思汗灭乃蛮后率军第一次侵入西夏，攻破边境城堡力吉里寨，毁其墙垒。但此次主要的目的是掠夺财富。开禧三年秋，成吉思汗以西夏不肯纳贡称臣为由，第二次侵入西夏，攻破斡罗孩城，四出掳掠。西夏会集右厢诸路军抵抗，蒙古军不敢深入，于次年春天退回。
嘉定二年（公元1209年）秋，成吉思汗第三次入侵西夏。他围攻兴庆府长达两个月，迫使西夏王纳女请和，每年向蒙古纳贡。西夏因向金求援遭到拒绝，遂转而采取了臣服蒙古向金国进攻的政策。
蒙古与金很早就是仇敌。嘉定二年，金章宗病死，完颜永济继位。成吉思汗从投到自己麾下的金朝叛臣口中对金朝的政局了如指掌。嘉定四年三月，他做好了伐金的一切准备。在为祖先复仇的口号下，成吉思汗对金朝展开了全面攻势。金军以30万大军守野狐岭（今河北万全膳房堡北），成吉思汗挥师攻之，金军大败，死者蔽野塞川。金将完颜承裕等慌忙觅路逃跑，蒙古军跟踪追至浍河堡（今河北怀安东），将金军大部分消灭。蒙古军前锋突入居庸关，攻中都（今北京）不克，退出关外。
接着，成吉思汗分兵四出，攻取了山西、河北、山东和东北的许多地方。金主永济柔弱无能，见蒙古军来势凶猛，未战就先乞和。嘉定六年，胡沙虎以怠忽职守受责，竟发兵入都，杀永济，另立完颜珣，自为太师、尚书令。元帅右监军术虎高琪因兵败惧罪，又先下手杀掉了胡沙虎。金朝统治一片混乱。
嘉定七年（公元1214年），成吉思汗从山东返回，驻中都北郊。他派人告诉金主：现蒙古军要撤退，你应犒赏兵马。金帝不敢乘蒙古军长途跋涉困乏之机反攻，只得派丞相完颜福兴为使节，献永济女歧国公主及童男童女、金帛骏马等求和。成吉思汗返回漠北。
金朝因国力衰竭，已无力守住中都，为躲避蒙古的压迫，准备迁都河南汴京。恰在这时，发生了金国阻止蒙古派往南宋的和平使节的事件。成吉思汗对此非常气恼，认为金国的所作所为是破坏条约准备再战。他再次下令策马南进。蒙古军逼近中都并将其包围，中都附近州县守将和官员纷纷投降，前来救援的金军均被击溃，留守中都的金军主帅抹燃尽忠弃城而逃。1215年5月，蒙古军进占中都，驻在桓州的成吉思汗派失吉忽秃忽将中都府藏尽数运走，并派兵驻守中都。
嘉定十年，成吉思汗在漠北图拉河畔，对从军多年的将士讹功行赏，同时改编部队。深得成吉思汗信任的木华黎被封为国王，全权指挥对金战争。嘉定十二年，成吉思汗扬鞭策马踏上西征之路。
五、对外兴兵远征欧亚
在蒙古铁骑向西挺进的征程上，首当其冲的是地处中亚的花刺子模国。花剌子模是中亚古国之一，位于阿姆河下游。其王号花剌子模沙（波斯语，意为王）。它摆脱了西辽和墨尔柱帝国的统治之后，发展成为伊斯兰世界最强大的国家。成吉思汗攻入金国的消息传到中亚后，花剌子模国国王摩诃末算端为证实这一消息并探听蒙古实力，在嘉定八年（公元1215年）底派以巴哈丁·剌只为首的花剌子模使团到达中都，亲睹了战争带来的惨状。当时成吉思汗并无征服西方的计划，只是着意于通过贸易获得异国物品。他曾颁布一道法令：凡商人至其境者，将保证其安全营业；凡有贵重物品，需先送到他那里由他选购。
一次双方进行贸易时，蒙古商队在花剌子模的论答刺城被该城长官亦难出全部拘捕，亦难出还向摩诃末诬告这些人是间谍，摩诃末没有深思熟虑，将他们全部杀死（共450人），货物全部没收。成吉思汗闻讯后，决意兴兵复仇。他派3个使臣到花剌子模指责摩诃末背信弃义，并要求交出凶手亦难出。摩诃末严辞拒绝，下令杀死为首的使臣，将其余二人剃去胡须，驱逐出境。成吉思汗派往花剌子模的使臣都是伊斯兰教徒，胡须对伊斯兰教徒来说是权力的象征，割掉它是奇耻大辱，而不斩来使、不杀说客是国家间交往的惯例。摩诃末如此做，激怒了成吉思汗，他派遣先锋哲别率领一支军队，消灭了盘距西辽的乃蛮部太阳汗之子屈出律，扫除了进兵路上的障碍。嘉定十二年（公元1219年），成吉思汗待马群肥壮之后，率领蒙古军和金国、西夏新归附的契丹军、汉军、河西军和畏兀儿、哈剌鲁首领率领的军队以及大批能工巧匠，翻越阿尔泰山，开始了西征。成吉思汗的军队总数不足20万，但其军威严整，战斗力很强。当时花剌子模拥有约40万军队，但其组织庞杂，训练不足，士气低落。在大敌压境之时，摩诃末有些惊慌失措。花剌子模的太后权势极盛，掌握着大量土地，摩诃末考虑到与母后的矛盾，采纳了分兵把守城堡的策略，他自己则准备退缩到阿母河以南，并随时准备放弃河中。
嘉定十二年秋，成吉思汗统全军向花剌子模进发，抵达讹答刺。经过5个月的苦战，蒙古军队终于攻破城防。守将亦难出率余部继续抗击，最终被生俘。蒙古军杀掠之后夷平了讹答剌城。亦难出被送往驻屯在撤麻耳干的成吉思汗处。成吉思汗下令往爱财如命的亦难出的眼睛和耳朵里灌注熔化了的银块，将其杀死，给死于非命的蒙古商人报了仇。
术赤一军攻下昔格纳黑（今哈萨克契伊利东南）、小八真（在昔格纳黑西北），逼临毡的。守将弃城逃跑，城民自动组织抵抗，因缺乏作战经验，很快被蒙古军攻破。
成吉思汗与拖雷率领人数最多的中军渡忽章河后攻克讷儿等城，于嘉定十三年（公元1220年）二月抵不花剌。不花剌是中亚细亚的大城市，守卫该城的是上万名骑兵。蒙古军进行了连续不断的进攻。守将率领一部分人马逃跑，结果被蒙古军队尾追至阿母河附近消灭。第二天，不花剌城的僧官、绅士们献城请降。成吉思汗入城后，乘马直入回回礼拜寺，在那里设宴庆功。
嘉定十三年三月，成吉思汗把烟火冲天的不花剌抛置身后，又开始进围河中首府撒麻耳干（意为“肥沃的都市”，摩诃末在吞并河中后以此为都城，今撒马尔罕）。察合台与窝阔台也率军来此会合，各驱降民随军攻城。摩诃末听到蒙古军进入河中的消息，慌忙逃离撒麻耳干，退到阿母河以南。撒麻耳干的城防尚未峻工，城中五六万守军竟不敢出战。围城第三日，有一部分城民出城突袭蒙古军，但中了埋伏，全部被歼。第五日，守军和城民献城投降。蒙古军入城后，拆毁城堞，逐出市民，纵兵大掠。成吉思汗将投降的将卒3万多人包围在一处平野中，全部杀死。他从居民中选出工匠3万人分赐诸子、亲属，并选3万名壮丁随军作战。其余居民则在交纳赎金后许其回城。契丹人耶律阿海受命为达鲁花赤，留此镇守。
阿剌黑一路蒙古军队也很快就攻取别纳客忒等城。
成吉思汗先驻扎在撒麻耳干城区，后移兵牧草丰美之地，休养士马，以待再战。一俟秋高马肥时，他就派遣察合台、窝阔台率领右翼军去取玉龙杰赤，命术赤率本部兵从其驻营地南下会合。自己与拖雷统领中军向阿母河挺进。
摩诃末携带少数侍从匆匆逃向可疾云（今伊朗德黑兰省加兹温）。哲别、速不台奉成吉思汗之命去追，他们渡过阿母河，进抵巴里黑，城民纳款请降，遂留一将镇守，随即分兵向西追赶。沿途传檄谕降，除非遇到阻拦、反抗，并不攻城略地。后摩诃末遁入小岛上，成为伊斯兰教徒。约在嘉定十三年底，摩诃末病死，他的儿子札兰丁继承了王位。
依照成吉思汗之命，察合台、窝阔台和术赤先后率军抵达花剌子模首都玉龙杰赤（今土库曼斯坦库尼亚乌尔根奇）。玉龙杰赤城跨阿母河两岸，中有桥梁相连，3000蒙古军欲夺取桥梁，结果全被守军杀死。城内守军胆气更壮，屡屡挫败攻城的蒙古军。
成吉思汗和拖雷率领中军从那黑沙不出发，过铁门关（今乌兹别克沙赫尔夏勃兹南90公里拜松山中的布兹加勒山口）南下。他从诸军中选拔强悍者组成一支精锐部队，命拖雷率领，先渡阿母河去取呼罗珊诸城；自统大军进攻阿母河北岸要塞忒耳迷（今俄罗斯捷尔梅兹）。忒耳迷军民拒绝招降。两军以石炮相战，围攻11天之后，城池被攻破。成吉思汗下令毁其城堡，尽屠其民。其后，他又分兵攻略附近诸城寨。
在阿母河北岸驻冬之后，嘉定十四年初，成吉思汗统兵渡河，抵巴里黑城下。城民首领带着昂贵的贡物出城请降，宣誓效忠。但成吉思汗为讨伐札兰丁，认为军队后方留下人口众多的城市于己不利，便以调查人口为名，将无辜的市民全部屠杀，将巴里黑城化为灰烬。
成吉思汗接着进围塔里寒寨（今阿富汗木尔加布河上游之北）。塔里寒军民凭险据守，蒙古军7个月围攻不下，直到拖雷奉召回军与其父会合，才将这座山城攻克。该城军民被屠杀殆尽。
这期间，拖雷受父命进入呼罗珊地区，对敢于反抗蒙古的城市进行了残酷的报复。所到之处多屠城，不允许投降。
嘉定十四年（公元1221年）十一月二十四日，成吉思汗下令猛攻札兰丁。经过激烈战斗，札兰丁部下将卒大部分死伤逃散，札兰丁数次突围受阻，脱掉盔甲，跃马入河，率4000残兵逃入印度。嘉庆十五年春，成吉思汗命八剌等率领蒙古军20000入印度追击札兰丁，但一直未找到踪迹。入夏后，蒙古军不耐盛暑，只好退兵。不久后，札兰丁也被迫离开印度逃往波斯。
成吉思汗又分遣蒙古军去镇压各城的起义，哥疾宁、也里、巴里黑等城又一次遭到蹂躏。嘉定十五年春、夏两季，他都在“大雪山”（今兴都库什山）以南活动，先是在印度河附近清剿札兰丁的离散部队，而后避暑于八鲁湾川。九月，渡过阿母河，回到撒麻耳干地区驻冬。
哲别和速不台在摩诃末逃入里海后，继续率军抄掠波斯各地。嘉定十四年初，蒙古军入掠谷儿只（今格鲁吉亚），败其守军，旋即回兵，再至桃里寺（今伊朗东阿塞拜疆省大不里土），接受城中贵人贡纳，遂往攻篾剌哈（今伊朗东阿塞拜疆省马腊格）。蔑剌哈城民进行了抵抗，城破后遭到残酷屠杀。接着又南下攻克哈马丹，杀掠之后纵火焚城。此后挥师北攻拜勒寒城，城民杀死蒙古派来议和的使者，蒙古军猛攻，陷城后将居民屠杀殆尽。
嘉定十五年春，哲别等攻入谷儿只境内，攻破其首府沙马哈（今阿塞拜疆舍马台）。占领了位于太和岭（高加索山）与里海之间隘口上的打耳班（今达格斯坦捷尔本特）。嘉定十六年底，他们率军东返，沿亦的勒河（伏尔加河）南下，经由里海、成海北部，与成吉思汗会师。
成吉思汗为求长生之药，在西征途中就遣侍臣刘仲禄到山东莱州延请全真教宗师丘处机。丘处机推辞不过，经过一年多的艰苦跋涉，终于在嘉定十五年四月到达成吉思汗行营。成吉思汗当即接见，问道：“真人从远方来，有什么能使我长生的药吗？”丘处机指出：“长生之道，清心寡欲；一统天下，不嗜杀人；为治之方，敬天爱民。”成吉思汗派人翻译并做了记录。嘉定十六年二月，成吉思汗射猎时不慎落马，险些丧生，丘处机劝告说：“你年事已高，少出猎为宜。出猎坠马，是天的戒示。”成吉思汗说：“神仙所言甚是，朕为蒙古人，自幼喜爱乘马狩猎，怕积习难改。”
嘉定十五年，闻知西夏有变，成吉思汗决意东归蒙古。他任命花剌子模人牙剌瓦赤及其子麻速忽治理西域各城，并置达鲁花赤监察。长子术赤留在了钦察草原。嘉定十六年东归途中，成吉思汗驻夏于忽兰巴失。嘉定十七年夏又在也儿的石河驻夏。
在这期间，成吉思汗为加强对征服来的广大国土的统治，将它们分封给了诸子：也儿的石河以西，今咸海、里海之北，属于术赤；畏兀儿与河中之间，原西辽故地，属于察合台；从叶迷立（今新疆额敏）以北，包括今喀拉额齐斯河和阿勒泰山一部分的原乃蛮部地，属于窝阔台。他们与先前分封的成吉思汗的诸弟合撒儿、合赤温、斡赤斤、别里古台等“东道诸王”相对，被称为“西道诸王”。这3个封国即是后来的钦察汗国、察合台汗国和窝阔台汗国。分封诸子，使他们各拥封土，为后来因争夺汗位而产生的各系间的斗争埋下了种因，也最终导致了大蒙古